Abstract

Les bactériophages de Streptococcus thermophilus sont l'une des principales causes d'inhibition de la fermentation du lait lors de la production de yogourt et de certains types de fromages. Cette problématique associée aux phages de S. thermophilus est encore très présente dans l'industrie laitière moderne et il est donc important de développer des stratégies innovatrices pour contrôler ces virus. Pour ce faire, il est essentiel d'étudier ces phages en détail et ce, à plusieurs niveaux. Dans cette thèse, trois protéines structurales (ORF15, ORF17 et ORF18) du phage virulent DT1 de type-cos, impliquées dans les processus d'adsorption et de reconnaissance de l'hôte, ont été identifiées. Ensuite, le génome complet du phage virulent 2972 de type-pac a été séquencé et des analyses comparatives avec les autres génomes de phages de S. thermophilus disponibles ont mis en évidence des caractéristiques uniques de certaines protéines du phage 2972 ainsi que des généralités sur les phages de S. thermophilus. Finalement, l'expression globale des gènes des phages DT1 et 2972 durant le processus d'infection a été analysée à l'aide des puces à ADN.

Alternate abstract:

Streptococcus thermophilus bacteriophages are one of the main causes of inhibition of milk fermentation during the production of yogurt and certain types of cheese. This problem associated with S. thermophilus phages is still very present in the modern dairy industry and it is therefore important to develop innovative strategies to control these viruses. To do this, it is essential to study these phages in detail and at several levels. In this thesis, three structural proteins (ORF15, ORF17 and ORF18) of the virulent cos-type phage DT1, involved in the adsorption and host recognition processes, were identified. Then, the complete genome of the virulent pac-type phage 2972 was sequenced and comparative analyzes with other available S. thermophilus phage genomes highlighted unique characteristics of certain phage 2972 proteins as well as generalities on the phages of S. thermophilus. Finally, the overall gene expression of phages DT1 and 2972 during the infection process was analyzed using DNA chips.